En la película, vemos el trailer de Matrix Reloaded final. Los personajes principales de la película son Neo (Joseph Gordon-Levitt), Morpheus (Laurence Fishburne) y Trinity (Ellen Page). Nos damos cuenta que el cuento comienza con el lanzamiento del software por una organización secreta llamada la 'Trinidad Corporación para el público. Después del lanzamiento del software, también aprendemos que el software fue creado para ayudar a las personas a superar la corrupción y el mal. Ahora le corresponde a los programadores y creadores del software para hacer que el software disponible en forma de una aplicación para descargar de forma gratuita a todos los usuarios.
Sin embargo, fue sólo cuando una persona descargarse la aplicación que todo el mundo tiene acceso a la aplicación. La Trinidad Corporación continuación, se vio obligado a revelar la existencia de la aplicación y requiere la persona que hizo la solicitud para liberar de forma gratuita. Para evitar esto, el creador de la aplicación, Mateo (uno de los programadores de software) había creado otro programa que limpie su anterior trabajo fuera del sistema informático. Sin embargo, todo el programa no fue capaz de completar su misión como la aplicación fue robada por otro programador llamado Trece (Terry Crews).
Después de esto, la Trinidad Corporación también tuvo que pagar una gran suma de dinero para el creador de la aplicación para que pudiera tener una entrada de registro eliminado. También se reveló en la película que Neo también había recibido la solicitud para descargar de forma gratuita desde su amigo Morfeo. Sin embargo, nunca fue capaz de descargar la aplicación y la descarga sólo le llevaría un par de minutos. Al final, no fue capaz de descargar completamente la aplicación y que todavía sufren las secuelas del software debido a la corrupción que ya sufrió cuando trató de descargar la aplicación.
